Durante el ejercicio extenuante o con bajas reservas de energía, así como durante una infección y/o enfermedad, el consumo de glutamina por las células inmunes es alta, esta mayor demanda de glutamina, unido al mayor uso de este aminoácido por otros tejidos, como el hígado, pueden llevar a un déficit de glutamina en el cuerpo humano, de esta manera se cogerían aminoácidos que tienen como principal función la creación de masa muscular (entre ellos los BCAA’s), eximiéndolos de esta función para llevarlos a crear glutamina y, de esta manera, disminuir masa muscular.